En 1795 es Enriqueta Aymer la que conoce la Asociación del Sagrado Corazón. Aceptada, no sin dificultades al principio, pronto se va cohesionando en torno a ella un grupo al que se le llamó las “solitarias”. El Buen Padre, por su parte, algo más libre de cargos pastorales, puede dedicar más tiempo a hacer progresar el proyecto que se está gestando.

En marzo de 1797 tiene lugar una conversación entre el P. Coudrin y Enriqueta, donde parece formularse por primera vez la decisión práctica de fundar: la resolución de comprar una casa y el comienzo de un tipo de vida religiosa a partir del grupo de las Solitarias. En agosto, este grupo hace “resoluciones” y se viste el hábito. Ahí se encierra ya todo los que se desarrollará más tarde. Paralelamente, el P. Coudrin se preocupaba de formar la rama masculina, después de unos primeros tanteos sin éxito.

En 1799 el Buen Padre y la Buena Madre deciden acelerar los tiempos de su independencia y libertad para manejarse como un grupo reconocido por la Iglesia. Obtienen ese mismo año una aprobación diocesana provisional, para profesar ambos al año siguiente los votos religiosos.

La Congregación va a seguir en la más rigurosa clandestinidad durante el período de la dominación napoleónica. Hasta 1817 no se recibirá la aprobación de Roma. Ello no impedirá, sin embargo, su desarrollo y crecimiento en miembros y en expansión geográfica. La confianza de los obispos va a posibilitar diversas fundaciones de hermanos y hermanas. El Buen Padre ejerce de Vicario General en varias diócesis sucesivamente. Los hermanos son encargados de la dirección y enseñanza de seminarios y se ponen en marcha escuelas que serán las que surten de vocaciones.

Muy pronto la Congregación desarrollará también otros ministerios como las misiones populares y aceptará –cuando la labor educativa se hace más difícil por las trabas legislativas- trabajar en las misiones más lejanas. Al mismo tiempo, y tras la aprobación por Roma, el Buen Padre atiende a las tareas de completar la institucionalización de la nueva comunidad, para lo cual son fundamentales los Capítulos Generales de 1819 y 1824.